Tras la finalización de la primera fase de la FIBA Europe Cup los 32 equipos clasificados para la 2ª fase de la competición quedan encuadrados de la siguiente manera:

GRUPO O:

• ASVEL LYON VILLEURBANNE
• KRKA NOVO MESTO
• MACCABI RISHON LE ZION
• JOENSUUN KATAJA

GRUPO P:

• ANTWERP GIANTS
• CEZ NYMBURK
• BK VENTSPILS
• LUKOIL ACADEMIC

GRUPO Q:

• TELENET OOSTENDE
• TURK TELEKOM ANKARA
• SLASK WROCLAW
• BORAS BASKET

GRUPO R:

• CHALON/SAONE
• FOXTOWN CANTU
• ENISEY KRASNOYARSK
• TARTU ROCK

GRUPO S:

• CIBONA ZAGREB
• LE HAVRE
• PIENO ZVAIGZDES
• ENERGIA TARGU

GRUPO T:

• BELFIUS MONS HAINAUT
• BAKKEN BEARS
• KHIMIK YUZHNY
• JUVENTUS UTENA

GRUPO U:

• FRAPORT SKYLINERS
• ROSA RADOM
• ROYAL HALI GAZIANTEP
• SODERTALJE KINGS

GRUPO V:

• OPENJOBMETIS VARESE
• MAGNOFIT GUSSING
• AEK LARNACA
• TSMOKI MINSK